שלוש שנים לאחר הסכם אביתר וחצי שנה לאחר ההסדרה, נחנך מחדש בית המדרש לזכרו של יהודה גוואטה הי"ד והוכנס ספר תורה בנוכחות אביו אלישע שאמר: "יהודה ואביתר פתחו לנו את ההתיישבות בשומרון שחיכתה עשרות שנים". ראש מועצת שומרון יוסי דגן: "רגע מזוקק של ניצחון הרוח והצדק, הקמת ישובים נותנת כח לנצח במלחמה"
יהודה גוואטה נרצח בפיגוע ירי בדיוק 8 שנים לאחר שאביתר בורובסקי שעל שמו נקרא הישוב נרצח באותו מקום בדיוק.
בטקס השתתפו מאות בני אדם בהם: ראש מועצת שומרון יוסי דגן, יו"ר תנועת נחלה צבי אלימלך שרבף, אלישע, אביו של יהודה גוואטה הי"ד, ח"כ צבי סוכות, יונתן פולארד, תושבי הישוב ומאות בני אדם.
אלישע אביו של יהודה הי"ד: "יהודה בן ירושלים היה בדרכו לישיבתו באיתמר ללמוד תורה, נפגע בשער הכניסה לשומרון, בארצו של יוסף הצדיק, בדיוק באותו מקום ובאותו יום שבו נרצח אביתר בורובסקי הי"ד לפני 8 שנים. למעשה הם פותחים לנו את ההתיישבות בשומרון שחיכתה עשרות שנים להתיישבות חדשה, 'כי דמים בדמים נגעו' והסתר הפנים נועד לבניית קומה חדשה בארץ ישראל, לתועלת הבניין"
יוסי דגן, ראש מועצת שומרון, אמר בטקס: "הכנסת ספר התורה לישוב אביתר היא רגע של ניצחון – ניצחון של האמת על השקר, של החיים על המוות. ההתיישבות כאן אינה רק סמל רוחני אלא גם כוח פיזי המעצים את צה"ל ואת העם כולו. משפחות הנופלים, גורובסקי וגואטה, אתם מגדלור של אמונה וגבורה. יחד נמשיך להאיר את הדרך ולבנות עוד אלפי יישובים ביהודה ושומרון".
ח"כ צבי סוכות: "התרגשתי מאוד להגיע לחנוכת בית המדרש באביתר לזכרו של יהודה גואטה הי״ד. עבורי זוהי סגירת מעגל מרגשת במיוחד, לאחר שהגעתי לבית המדרש הזה רבות כשהקמנו את אביתר וכעת אנחנו זוכים לחנוך אותו מחדש לאחר שהיישוב אושר על ידי הממשלה בהובלת יו״ר הציונות הדתית השר בצלאל סמוטריץ׳ ובדחיפת יו״ר מועצת שומרון יוסי דגן. בדמייך חיי".
צבי אלימלך שרבף, יו"ר תנועת נחלה: "מסירות הנפש של משפחת גואטה, יחד עם המסירות המתמשכת של תושבי הישוב, פעילי תנועת נחלה והציבור הרחב שתמך וסייע ללא הפסקה, הם שהובילו אותנו לרגע הזה. תודה מיוחדת לראש המועצה יוסי דגן על הגיבוי המלא והשותפות לאורך כל הדרך. הקמת אביתר מסמלת פריצת דרך בהקמת ישובים חדשים אחרי שנים של הקפאה, ובעזרת השם, נמשיך ונבנה בכל רחבי הארץ, ובקרוב גם בחבל עזה. ברוך ה' שאנו זוכים להיות חלק מהתהליך החשוב הזה, המחזיר את העם היהודי לאדמתו".
תחיה חיים, נציגת מזכירות אביתר: "לפני שלוש וחצי שנים סיימה משפחת גואטה היקרה את כתיבת ספר התורה הראשון לע''נ יהודה הי''ד וחלמה להכניס אותו לבית המדרש על שמו באביתר. שלוש וחצי שנים, חיכה הספר לעלות אל ההר הטוב הזה. אביתר, מרגע הקמת הישוב, מרימה גבוה את דגל ההתיישבות. בטוחים שגם הכנסת ספר התורה המרגשת היום, היא האות בע''ה להכנסות ספרי תורה ליישובים חדשים בחבל עזה בקרוב. עלה נעלה וירשנו אותה כי יכול נוכל לה".